全外顯子測序
? ??技術簡介
全外顯子測序(Whole?Exome Sequencing,WES)是較常見的基因組測序方法,通過利用探針雜交富集外顯子區域的DNA序列,進行高通量測序,來發現與蛋白質功能變異相關遺傳突變的技術手段。外顯子是人基因組的蛋白編碼區域,雖僅占全基因組1%左右,但覆蓋了85%的致病突變。通過測序所獲取的數據,結合大量的公共數據庫提供的外顯子致病信息,有利于更好地解釋所得變異與疾病的關系。相比于全基因組測序,外顯子組測序更高深度、更加經濟、高效。
?
? ??技術優勢
?
l?直接對蛋白編碼序列進行測序,擁有可靠的基因突變鑒定方案和權威的突變鑒定軟件,找出影響蛋白結構的變異
l?高捕獲效率,高深度測序,可發現變異頻率低于1%的罕見變異
l?僅針對外顯子組區域,有效降低測序費用、存儲空間和工作
?
?
? ??技術流程
?

?
? ??應用領域及檢測意義:
l?單基因遺傳病:單基因病(孟德爾遺傳病)的輔助診斷
l?復雜性疾病:涉及多個系統的復雜疾病輔助診斷
l?家系/群體分析:通過大量病例關聯分析,尋找新基因或已知基因的新突變
?
? ??數據分析
信息分析從測序的下機數據(raw data)開始,原始下機數據過濾掉接頭、低質量堿基、未測出的堿基(以N 表示)后比對到參考基因組上,進行SNP檢測和InDel或者CNV分析,然后通過數據庫注釋,對變異檢測的結果通過基于變異有害性、樣本情況和基因功能表型三種分析策略,篩選出于疾病相關的有害性位點或基因。另外, 為了保證高質量的測序數據,在整個分析流程中設置了嚴格的數據質控體系(QC)。
?
? ??樣本類型
高純度DNA僅需50ng,全血僅需50ul,同時,來自羊水、流產物、干血片的DNA均可得到和正常樣本均一性和覆蓋度相差無幾的測序結果。
?
? ??適宜人群
1.?所有單基因遺傳病疑似患者
2.?臨床危重病癥,預后判斷困難,需要明確診斷并選擇精準治療方案的患者
3.?臨床表型異質性強,病因復雜,常規診斷困難的多系統復雜疾病及綜合征患者
4.?已用系統panel檢測,但仍未確診的家族遺傳病患者
5.?家庭已有明確致病基因遺傳病息者,擬生育第二胎進行遺傳咨詢的患者及其親屬
?